Am 27.11.1984 eröffnete Klaus J. Jacobs in Zürich das von ihm gegründete Museum unter dem Namen „Jacobs Suchard Museum“. Nach dem Verkauf von Jacobs Suchard an Philipp Morris im Jahr 1990 ging der Bestand des Museums in die ebenfalls in Zürich beheimateten Jacobs Stiftung über. In der Folge erhielt das Museum seinen heutigen Namen: Johann Jacobs Museum. Dieser erinnert an den Grossonkel des Museumsgründers, Johann Jacobs (1869-1958), welcher im Jahr 1895 mit der Eröffnung seines „Specialgeschäft in Caffee, Thee, Cacao, Chocoladen und Biscuits“ in Bremen den Grundstein zu dem erfolgreichen Jacobs Kaffee-Imperium gelegt hatte.